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| − | '''ハプログループDE(Y染色体)'''（ハプログループDE (Yせんしょくたい)、{{Lang-en-short|Haplogroup DE (Y-DNA)}}）とは、[[分子人類学]]で用いられる、[[人類]]の[[Y染色体]]の[[ハプログループ]]（型集団）の分類で、'''YAP'''と呼ばれる変異の型に定義されるものである。
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| − | ==YAP==
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| − | ハプログループDEはYAPという変異で定義される。YAP (ヤップ、{{en|Y-chromosome Alu Polymorphism}})とは、[[Y染色体]]の長腕部「DYS287 Yq11」上にある約300塩基からなるAlu配列([[:en:Alu element|Alu]] sequence)の挿入[[多型]]。この[[古代]]に起きた「M1」と定義される[[一塩基多型|変異の痕跡]]（SNP）を[[Y染色体]]上に持つのは、本来ならば[[tRNA]]、[[rRNA]]などの核内低分子RNAに転写されるべきものが、何らかの要因によってY染色体上のDNA配列に挿入されてしまったもので、生体内での働きについては未解明である。Alu配列とは[[蛋白質]]をコードする配列を全く含まず、制限酵素Aluで認識されるためこの名がつけられた。YAP変異をもつ系統は[[ハプログループE (Y染色体)|ハプログループE]]と[[ハプログループD (Y染色体)|ハプログループD]]に限られる<ref>[http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/7968488 Hammer MF.(1994) A recent insertion of an alu element on the Y chromosome is a useful marker for human population studies.]</ref>。
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| − | <!--Y FullとISOGGで系統樹が異なるため確定するまで保留
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| − | == 分岐系統の概略 ==
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| − | {{familytree/start|style=font-size:80%}}
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| − | {{familytree|border=0|001|001= [[YAP]]}}
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| − | {{familytree|border=0|001|001= [[ハプログループDE (Y染色体)|DE(M203)]]}}
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| − | {{familytree|border=0| |)|-|-|.| |}}
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| − | {{familytree|border=0|001|002|001=[[ハプログループD (Y染色体)|D(M174)]]|002=[[ハプログループE (Y染色体)|E(M96)]]<ref>[[アフリカ]]（[[バンツー]]語族等）</ref>}}
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| − | {{familytree|border=0| |)|-|-|.| |}}
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| − | {{familytree|border=0|001|002|001=D1(CTS11577)<ref>[[チベット]]・[[日本]]共通祖</ref>|002=D2(L1378)<ref>[[フィリピン]]</ref>}}
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| − | {{familytree|border=0| |)|-|-|-|-|-|.| |}}
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| − | {{familytree|border=0|001|002|003|001=[[ハプログループD1a (Y染色体)|D1a(Z27276)]]<ref>[[チベット]]</ref>|002=|003=[[ハプログループD1b (Y染色体)|D1b(Z3660)]]<ref>[[日本]]・[[アンダマン諸島]]共通祖</ref>}}
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| − | {{familytree|border=0| |)|-|-|.|||)|-|-|.|}}
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| − | {{familytree|border=0|001|002|003|004|001=D1a1(M15)<ref>[[チベット]]、[[日本]]</ref>|002=D1a2(P99)<ref>[[チベット]]</ref>|003=D1b1(M64.1)<ref>[[日本]]</ref>|004=D1b2(Y34637)<ref>[[ジャラワ]]、[[オンゲ族|オンゲ]]</ref>}}
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| − | {{familytree|border=0| |||||||)|-|-|.|}}
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| − | {{familytree|border=0|001|002|003|004|001=|002=|003=D1b1a(Z1622)<ref>[[日本]]</ref>|004=D1b1b(Z1516)<ref>[[日本]]</ref>}}
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| − | {{familytree/end}}
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| − | source:<br>
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| − | Y Full Haplogroup YTree (v6.02) at 02 April 2018<br>
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| − | ISOGG Haplogroup YTree (v13.107) at 05 May 2018<br>
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| − | -->
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| − | == 起源 ==
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| − | [[File:Yap tree.gif|thumb|350px|[[Y染色体]][[Y染色体ハプログループ|分岐]]の[[系図|系統図]]]]
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| − | 現生[[人類]]の[[最も近い共通祖先|共通祖先]]発祥の地、[[東アフリカ]]の[[トゥルカナ湖]]の東北附近に約6.5万年前<ref>Karafet TM, Mendez FL, Meilerman MB, Underhill PA, Zegura SL, Hammer MF (2008). "New binary polymorphisms reshape and increase resolution of the human Y chromosomal haplogroup tree". Genome Research 18 (5): 830–8. doi:10.1101/gr.7172008. PMC 2336805. PMID 18385274.</ref>に住んでいた一人の男性にこの変異が起こりこれが、父系で[[遺伝]]する[[Y染色体]]の特定のSNPを持つ集団（[[Y染色体ハプログループ]]）のうち「YAP（M1)」と呼ばれるSNPを持つハプログループDE系統を生み出し、その後6万年程前にこれが更に2つ集団（[[ハプログループ]]）[[ハプログループD (Y染色体)|D]]と[[ハプログループE (Y染色体)|E]]に分岐した。<br />
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| − | なお、'''ハプログループDE'''は系統樹からも分かるように、全ユーラシア人の[[最近共通祖先]]である[[ハプログループCT (Y染色体)|ハプログループCT]]から早期に分岐したため、他の[[ユーラシア]]系統とは分岐から7万年以上もの年月を経ている。（一方で、ハプログループDEはアジアで発祥したという説<ref>{{Cite journal|last=Cabrera|first=Vicente M.|last2=Rodriguez|first2=Julia Patricia Marrero|last3=Abu-Amero|first3=Khaled K.|last4=Larruga|first4=Jose M.|date=2017-12-13|title=Carriers of mitochondrial DNA macrohaplogroup L3 basic lineages migrated back to Africa from Asia around 70,000 years ago.|url=https://www.biorxiv.org/content/early/2017/12/13/233502|journal=bioRxiv|pages=233502|language=en|doi=10.1101/233502}}</ref>もある。）
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| − | [[アフリカ]]に留まり（又は出戻り）アフリカ大陸全土や一部は[[地中海世界|地中海地域]]や[[ヨーロッパ]]などに父系を通じて広がった集団が'''[[ハプログループE (Y染色体)|ハプログループE]]'''であり、分岐後出アフリカを経て東方に向かい、[[チベット人|チベット]]・[[アンダマン諸島人|アンダマン諸島]]・[[ヤオ族]]・[[フィリピン]]の[[マクタン島]]・[[グアム島]]・[[日本列島]]<ref>{{cite web |url=http://eng.molgen.org/viewtopic.php?t=344 |title=Y-haplogroup D in Cebu, Philippines |publisher=A Genetic Genealogy Community |date=2012-05-12 |accessdate=2014-03-03 |archiveurl=https://web.archive.org/web/20141014162752/http://eng.molgen.org/viewtopic.php?t=344 |archivedate=2014年10月14日 |deadurldate=2017年9月 }}</ref>などに父系を通じて広がったのが'''[[ハプログループD (Y染色体)|ハプログループD]]'''である。
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| − | またDEの子型でD系統にもE系統にも属さないパラグループDE*が[[シリア]]、[[チベット人]]、[[ナイジェリア]]などの[[西アフリカ]]でごくわずかに発見されている<ref>Weale ME, Shah T, Jones AL et al. (September 2003). "Rare deep-rooting Y chromosome lineages in humans: Lessons for Phylogeography". Genetics 165 (1): 229–34. PMC 1462739. PMID 14504230. </ref><ref>Shi H, Zhong H, Peng Y et al. (2008). "Y chromosome evidence of earliest modern human settlement in East Asia and multiple origins of Tibetan and Japanese populations". BMC Biol. 6: 45. doi:10.1186/1741-7007-6-45. PMC 2605740. PMID 18959782. </ref>。
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| − | ==下位系統==
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| − | *'''DE'''
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| − | **DE* [[シリア]]、[[ナイジェリア]]、[[チベット]]で見つかっている。
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| − | **[[ハプログループD (Y染色体)|D]]
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| − | ***D*
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| − | ***D1
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| − | ****[[ハプログループD1a (Y染色体)|D1a]] チベット、[[日本]]
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| − | ****[[ハプログループD1b (Y染色体)|D1b]] [[日本]]で頻繁に見られる。[[アイヌ人]]に多い。
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| − | ***[[ハプログループD2 (Y染色体)|D2]] [[フィリピン]]で見つかっている。
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| − | **[[ハプログループE (Y染色体)|E]] アフリカで多い。[[コンゴイド]]人種。
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| − | ***E1b1a アフリカ中~南部。[[ニジェール・コンゴ語族]]と関連。
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| − | ***E1b1b アフリカ北東部・北部、[[中東]]、南[[ヨーロッパ]]など。[[アフロ・アジア語族]]と関連。
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| − | == YAP因子を持つ有名人 ==
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| − | '''ハプログループD'''
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| − | *[[須藤元気]]
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| − | *[[竹村健一]]
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| − | *[[細川茂樹]]
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| − | *[[堀江貴文]]
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| − | '''ハプログループE'''
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| − | *[[アルベルト・アインシュタイン]]
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| − | *[[バラク・オバマ]]
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| − | *[[リンドン・ジョンソン]]
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| − | *[[アドルフ・ヒトラー]]
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| − | *[[ナポレオン・ボナパルト]]
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| − | *[[ネルソン・マンデラ]]
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| − | *[[ライト兄弟]]
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| − | {{Y-DNA}}
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| − | == 脚注 ==
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| − | <references/>
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| − | == 関連項目 ==
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| − | {{雑多な内容の箇条書き|section=1|date=2013年7月14日 (日) 16:20 (UTC)}}
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| − | {{Col-begin}}
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| − | {{Col-break|width=45%}}
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| − | *[[Y染色体]]
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| − | *[[Y染色体アダム]]
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| − | *[[Y染色体ハプログループ]]
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| − | *[[ミトコンドリア・イブ]]
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| − | *[[ハプログループ]]
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| − | *[[ハプログループCT (Y染色体)]]
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| − | *[[Y染色体ハプログループの分布 (東アジア)]]
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| − | {{Col-break|gap=3em}}
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| − | *[[古人類学]]
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| − | *[[分子時計]]
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| − | *[[分子時計#ヒトの進化の分子時計]]
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| − | *[[一塩基多型]] ([[SNP]])
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| − | *[[マイクロサテライト]] (STR)
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| − | *[[アフリカ単一起源説]]
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| − | *[[古人類学#現在論じられている人類進化説|アフリカサバンナ起源説]]
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| − | *[[最も近い共通祖先]]
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| − | *[[ジェノグラフィック・プロジェクト]]
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| − | {{Col-end}}
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| − | == 外部リンク ==
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| − | *[http://www.haplogroups.com/haplogroups/haplogroup-m1/ Haplogroup M1]
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| − | {{Biosci-stub}}
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| − | {{デフォルトソート:はふろくるうふDE Yせんしょくたい}}
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| − | [[Category:分子人類学]]
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| − | [[Category:人類の進化]]
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| − | [[Category:Y染色体ハプログループ]]
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